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| Acadêmico(a): Edson José Savi Junior |
| Título: Alinhamento de Seqüências Biológicas em Ambiente Distribuído |
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| Resumo: |
| O alinhamento de seqüências biológicas é uma das principais operações da bioinformática, pois serve como base para outros processos nesta área. Por meio do alinhamento de seqüências é possível compará-las em busca de similaridades em suas estruturas. Essa comparação permite inferir sobre as propriedades de determinada molécula, baseando-se em propriedades conhecidas de outras. Entretanto, esta tarefa exige alto poder de processamento, sendo necessários, em geral, computadores de alto desempenho. O objetivo deste trabalho foi o de adaptar uma ferramenta de alinhamento de seqüências biológicas open source, conhecida por JAligner, de forma a permitir a realização do processamento do alinhamento das seqüências em ambiente distribuído, possibilitando com isso a utilização de uma infraestrutura computacional de menor custo. Para viabilizar o processamento em ambiente distribuído foram utilizadas as bibliotecas JPVM e JOMP. |
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