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| Acadêmico(a): Guilherme Dala Rosa Bacca |
| Título: VONCELL: um protótipo para análise morfométrica de ilhotas pancreanas |
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| Conclusão: |
A proposta desse trabalho era desenvolver uma ferramenta que permitisse segmentar ilhotas pancreáticas em
amostragens de laboratório, além de extrair características morfométricas. As imagens foram obtidas em laboratório, e
em todas elas foram inseridas uma pequena marcação no canto inferior direito, referente à escala, que será usada para os
cálculos morfométricos. O software foi desenvolvido na linguagem Python, utilizando-se na maior parte do tempo a
biblioteca de processamento de imagens OpenCV.
Mais especificamente, a segmentação poderia ter um ajuste do usuário pela interface gráfica. Esse ajuste é do
valor de limiar usado pelo programa para segmentar a imagem, uma vez que as imagens são diferentes tanto em
coloração quanto no formato e localização da ilhota. Nem sempre os valores padrão entregavam um bom resultado,
porém com o ajuste, quase em todos os casos seria possível segmentar de maneira satisfatória.
Para atender o primeiro objetivo específico, o de segmentação, foram utilizados a imagem original e o canal G
do modelo de cor RGB e também operadores morfológicos de dilatação e erosão, além dos algoritmos de clusterização
K-means e MeanShift. Esses métodos foram repetidos algumas vezes para que se chegasse em um melhor resultado, ou
seja, a segmentação não é feita de primeira, e sim há uma sequência de passos utilizando esses algoritmos para ir
filtrando a ilhota na imagem.
Posteriormente, com uma boa segmentação, o segundo objetivo específico que é a extração das informações
morfométricas ficou facilitado, uma vez que, com a área da ilhota segmenta, a mesma é apresentada, possibilitando o
cálculo da circularidade e obtenção do perímetro da ilhota. A área é obtida em pixel pelo programa, e através da escala é
obtida a área. A circularidade é medida baseando-se no contorno da ilhota, porém com uma suavização do mesmo
através do método de envoltória convexa, que deixa o contorno mais regular. O contorno da ilhota também possibilita a
obtenção do perímetro. O terceiro objetivo, o de apresentar os resultados, é então atendido.
Quanto ao objetivo de segmentar a ilhota pancreática, com os valores utilizados para teste nem todas as ilhotas
foram bem segmentadas, mas vale ressaltar que foram testados apenas dois valores, o padrão e outro um pouco abaixo
desse. Se a segmentação padrão não apresentar resultado desejado, pode-se ajustar na interface os valores de limiar,
possibilitando o sucesso na maioria dos casos.
Contudo, obtendo-se resultado satisfatório no primeiro objetivo, facilita-se os cálculos para extração de
características morfométricas. O contorno entregue pelo algoritmo de contorno do OpenCV possibilita obter-se a área
em pixels do mesmo, e dividindo pela área da escala, chega-se à área da ilhota. Posteriormente, obtêm-se a
circularidade e perímetro, tudo baseado no contorno da ilhota. Em todos os casos de boa segmentação foram obtidos
resultados satisfatórios, porém quando não há boa segmentação, consequentemente não se obtém esses resultados.
Por fim, conclui-se que esse trabalho alcançou, ainda que parcialmente, os resultados esperados, faltando
apenas o objetivo específico mais difícil. Os resultados foram satisfatórios, mesmo testando poucos valores de limiar,
apenas por ser ajustável pode-se chegar ao resultado esperado em quase todos os casos. Isso já apresenta uma melhor
praticidade em relação a outros programas do gênero, sendo que não há um específico para o tema aqui abordado, sendo
necessário apenas algumas melhorias e mais funções, servindo inclusive de base para outros trabalhos que seguem a
mesma linha temática, de segmentação e medição morfométrica de ilhotas pancreáticas. Como sugestões de trabalhos
futuros indica-se a: (i) implementação do objetivo específico 3; (ii) padronização das cores para não haver tanta
dificuldade quando uma imagem tem coloração diferente; (iii) realização de comparações através da própria interface;
(iv) ajuste de segmentação manual, com manuseio dos pontos do contorno através da interface; (v) classificação dos
tipos de ilhotas em periacinar, perivasculares e periductais (para possível acompanhamento de evolução das ilhotas). |
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